E-Locus - Ιδρυματικό Καταθετήριο Πανεπιστημίου Κρήτης - Μελέτη του μεταβολισμού του θείου στο φωτοσυνθετικό βακτήριο Chlorobaculum tepidum

Αρχική Μελέτη του μεταβολισμού του θείου στο φωτοσυνθετικό βακτήριο Chlorobaculum tepidum

Αποτελέσματα - Λεπτομέρειες

[Προσθήκη στο καλάθι]

Κωδικός Πόρου

000430891

Τίτλος

Μελέτη του μεταβολισμού του θείου στο φωτοσυνθετικό βακτήριο Chlorobaculum tepidum

Άλλος τίτλος

Study of sulfur metabolism of photosynthetic bacterium Chlorobaculum tepidum

Συγγραφέας

Λυρατζάκης, Αλέξανδρος Γ

Σύμβουλος διατριβής

Τσιώτης, Γεώργιος

Μέλος κριτικής επιτροπής

Γανωτάκης, Δημήτριος
Παυλίδης, Ιωάννης

Περίληψη

ToChlorobaculumtepidumείναι ένα πράσινο θειούχο βακτήριο,που αναπτύσσεται παρουσία θειούχων και θειοθειικών αλάτων. Πρόκειται για ένα υποχρεωτικά αναερόβιο,φωτότροφο βακτήριο, που μεταβολίζει τα θειούχα και θειοθειικααλάταπρωτα σε ατομικό θειο καιμετά σε θειικά κατά την ανάπτυξη του. Το παραγόμενο στοιχειακό θείο μεταφέρεται στο εξωκυττάριο χώρο. Με στόχο την μελέτη του μεταβολισμού του θείου, συλλέχθηκαν κύτταρα κατά τη μέγιστη παραγωγή θείου (20h) και κατά τη στατική φάση ανάπτυξης(40h). Τα εξωκυττάρια σφαιρίδια στοιχειακού θείου απομονώθηκαν και αναλύθηκαν με MALDITOF και ηλεκτρονική μικροσκοπία σάρωσης (SEM). Στα κύτταρα που συλλέχθηκαν πραγματοποιήθηκε ανάλυση του ολικού πρωτεώματος και ποσοτικοποίηση με labelfreequantificationπροσέγγιση. Συνολικά, έγινε ταυτοποίηση σε 1132 πρωτεΐνες περίπου το 50% του θεωρητικού πρωτεώματος και από αυτές ποσοτικοποιήθηκαν πάνω από 990 με τον LFQαλγόριθμο. Από αυτές 130 είχαν στατιστικά σημαντική αλλαγή στην αφθονία, τους μεταξύ των δύο επιλεγμένων βιολογικών συνθηκών. Η λειτουργική και τοπολογική ανάλυση δείχνουν την αυξημένη αφθονία ενζύμων, που σχετίζονται με την οξείδωση θειούχων και θειοθειικών αλάτων στις 20h (dsrsystemκαι soxsystem). Τέλος, βάση των αποτελεσμάτων πρωτεομικής, δημιουργήθηκε ένα μοντέλο μεταβολισμού του θείου, που δείχνει πώς το κύτταρο μεταβάλλει την αφθονία των ενζύμων που σχετίζονται με την παραγωγή και την αποικοδόμηση των σφαιριδίων βιογενούς θείου.

Φυσική περιγραφή

112 φύλλα : πίν., σχήμ., εικ. (μερ.εγχρ.) ; 30 εκ.

Γλώσσα

Ελληνικά

Θέμα

Biostatistics

Mass spectrometry

Proteomics

Scanning Electron Microscopy

Βιοστατιστική

Ηλεκτρονική μικροσκοπία σάρωσης

Πρωτεωμική ανάλυση