Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
Τρέχουσα Εγγραφή: 2 από 652
|
Κωδικός Πόρου |
000466068 |
Τίτλος |
Exploring SecA conformation dynamics for the development of effective antibiotics |
Άλλος τίτλος |
Διερεύνηση της δυναμικής διαμόρφωσης της SecA για την ανάπτυξη αποτελεσματικών αντιβιοτικών |
Συγγραφέας
|
Γιώτας, Εμμανουήλ Π.
|
Σύμβουλος διατριβής
|
Ελευθεριάδης, Νικόλαος
|
Μέλος κριτικής επιτροπής
|
Παυλίδης, Ιωάννης
Γανωτάκης, Δημήτριος
|
Περίληψη |
Η SecA είναι μια κινητήρια πρωτεΐνη στα προκαρυωτικά κύτταρα, η
οποία συμμετέχει στον μηχανισμό έκκρισης προ-πρωτεϊνών έξω από το
κύτταρο. Είναι ένας σημαντικός παράγοντας στο μονοπάτι Sec και απαραίτητη
για την επιβίωση των βακτηρίων. Η αναστολή της δραστηριότητας της SecA
πιστεύεται ότι έχει καθοριστικό ρόλο στην ανακάλυψη νέων αντιβιοτικών. Η
SecA είναι ένας πολλά υποσχόμενος φαρμακευτικός στόχος, καθώς είναι
ζωτικής σημασίας για τα βακτήρια και δεν υπάρχει ανθρώπινο ανάλογο.
Σε αυτή τη διατριβή, η SecA παράχθηκε, καθαρίστηκε και η δράση
ΑΤΡάσης της χρησιμοποιήθηκε για τον εντοπισμό ισχυρών αναστολέων. Ένα
πρωτόκολλο υψηλής απόδοσης βασισμένο στο Malachite Green αναπτύχθηκε
και χρησιμοποιήθηκε για την εξέταση περισσότερων από 100 νέων ενώσεων
με διαφορετικές ιδιότητες. Η τιμή της συγκέντρωσης του αναστολέα ώστε να
μειωθεί η δράση της πρωτεΐνης στο μισό (IC50) μετρήθηκε για τις τέσσερις πιο
υποσχόμενες ενώσεις, και οι τιμές τους κυμαίνονταν από 160 μΜ έως 2 mM. Η
πιο αποτελεσματική ένωση, η MZ102, χρησιμοποιήθηκε για κινητικές μελέτες
ώστε να βρεθεί ο τύπος αναστολής, ο οποίος φάνηκε να είναι ανταγωνιστικός.
Επίσης, πραγματοποιήθηκαν πειράματα μοριακής μοντελοποίησης για να
βρεθούν οι αλληλεπιδράσεις της καλύτερης ένωσης με τη θέση πρόσδεσης του
ATP στην πρωτεΐνη, τα οποία έδειξαν ότι η MZ102 και το ATP καταλαμβάνουν
τον ίδιο χώρο μεταξύ των υπομονάδων NBD1 και NBD2. Πειράματα smFRET
χρησιμοποιήθηκαν για τη μελέτη της δυναμικής της πρωτεΐνης και βάσει
προηγούμενων ευρημάτων επαληθεύτηκε το πρωτόκολλο που
χρησιμοποιήθηκε. Τέλος, διερευνήθηκε η επίδραση της MZ102 στη δυναμική
της πρωτεΐνης, χρησιμοποιώντας smFRET, το οποίο έδειξε να επηρεάζεται
ελαφρώς τη μονομερή κατάσταση της πρωτεΐνης.
|
Φυσική περιγραφή |
80 σ. : πίν., σχήμ., εικ. (μερ. εγχρ.) ; 30 εκ. |
Γλώσσα |
Αγγλικά |
Θέμα |
Enzyme kinetics |
|
Inhibitors |
|
Novel antibiotics |
|
smFRET |
|
Αναστολείς |
|
Καινοτόμα αντιβιοτικά |
|
Κινητική ενζύμων |
Ημερομηνία έκδοσης |
2024-07-19 |
Συλλογή
|
Σχολή/Τμήμα--Σχολή Θετικών και Τεχνολογικών Επιστημών--Τμήμα Χημείας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
|
Τύπος Εργασίας--Μεταπτυχιακές εργασίες ειδίκευσης
|
Μόνιμη Σύνδεση |
https://elocus.lib.uoc.gr//dlib/c/4/4/metadata-dlib-1720773276-162543-14672.tkl
|
Εμφανίσεις |
477 |